Emi, một học sinh trung học xinh đẹp và nổi tiếng, bất ngờ bị hậu bối mình - Ren, một chàng trai lạnh lùng và khó gần - cưỡng hiếp sau giờ học. Sự việc đẩy Emi vào cảm giác hoang mang và bối rối. Ren không chỉ dừng lại ở việc cưỡng hiếp mà còn luôn theo đuổi Emi, khiến cô gái cảm thấy bị mắc kẹt trong cảm xúc khó định và lo sợ.
Những ngày tiếp theo, Emi không thể thoát khỏi sự ám ảnh của Ren. Anh chàng tỏ ra bí ẩn hơn, lạnh lùng hơn, khiến Emi không biết anh ta muốn gì. Điều đó khiến cô trở nên hoang mang hơn, và đồng thời cũng nảy sinh một kẻ thù lớn trong lòng mình.
Tuy nhiên, khi bí mật về quá khứ của Ren dần dần được hé lộ, Emi nhận ra rằng có những sự thật ẩn sau vẻ ngoài lạnh lùng và hung dữ của Ren. Cô bắt đầu hiểu rằng, sau cơn giông tố, có thể sẽ có bầu trời xanh như lúc ban đầu và tình cảm nảy nở từ những vết thương sâu kia.
Truyện tranh "Bị Hậu Bối Cưỡng Hiếp" không chỉ là câu chuyện về cảm xúc phức tạp giữa Emi và Ren mà còn là hành trình tìm ra sự tha thứ và sự hiểu biết của chính họ về bản thân và người khác.